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1. Pour pouvoir identifier des spécimens à partir de leur ADN, il est nécessaire de construire au préalable une base de données (comme la Barcode of Life Database, BOLD) dans laquelle des spécimens sont associés à des noms d’espèces et à un code-barre ADN. Chez les animaux, le code-barre utilisé est...

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Principe du DNA barcoding et du metabarcoding

L’énoyl-CoA carboxylase/réductase de Kitasatospora setae (entrée PDB 6OWE) est un tétramère. Le NADPH, représenté en orange, agit comme donneur d’électrons, tandis que le substrat, une molécule d’énoyl-CoA, est représenté en jaune.

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L'énoyl-CoA carboxylase/réductase de Kitasatospora setae

Photographie (A) et microtomographie aux rayons X (B).
Barre d'échelle : 1 cm.

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Macrofossiles pyritisés découverts dans des couches noires argileuses (black shales) près de Franceville, au Sud-Est du Gabon

A. Histoire phylogénétique réelle d’une lignée montrant les évènements de spéciation et de diversification génétique avec l’exemple des allèles A et B issus d’un même allèle ancestral. Les allèles A et B sont deux versions d’un même gène qui coexistent chez les trois espèces. B. Arbre phylogénétique...

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Le biais de la paralogie dans la reconstruction phylogénétique

Cet arbre représente la meilleure estimation de Parins-Fukuchi et coll., 2018. À la différence d’autres méthodes de construction d’arbres phylogénétiques, n’utilisant que des données morphologiques, les auteurs estiment, dans l’étude dont est tirée cette figure, qu’il est préférable de recourir en p...

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Arbre phylogénétique de la lignée humaine d’après Parins-Fukuchi et coll., 2018

Les nombres aux nœuds représentent à gauche le bootstrap de 0 à 100 des réplicats de l’analyse par maximum de vraisemblance et à droite la probabilité à postériori de 0 à 1 de l’analyse par inférence bayésienne. Le bootstrap est une mesure permettant d’évaluer la stabilité d’un clade lorsque l’analy...

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Arbre phylogénétique reconstruit par Madupe et coll., 2023

Les spécimens ont été trouvés dans la grotte de Swartkrans en Afrique du Sud à 40 km au Nord-Ouest de Johannesbourg. Les dépôts sédimentaires contenant ces fossiles sont datés d’environ 1,8 à 2,2 Ma. Ces spécimens étaient conservés au Musée national Ditsong d’Histoire naturelle. De gauche à droite :...

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Les quatre dents de Paranthropus robustus analysées par Madupe et coll., 2023

Le crâne original complet (sans la mandibule) de 1,8 million d'années de Paranthropus robustus (SK-48 provenant de Swartkrans (26°00'S 27°45'E), Gauteng), découvert en Afrique du Sud. Collection du Transvaal Museum, Northern Flagship Institute, Pretoria, Afrique du Sud.

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Crâne original de Paranthropus robustus

Les croix marquent les sites où l’ADN a été extrait de squelettes, les ronds marquent les sites où l’ADN a été extrait de sédiments. Le losange noir marque la grotte de Sefunim. Les fragments d'ADN les plus anciens jamais séquencés viennent du Groenland et datent de 2 Ma. En dehors du permafrost il ...

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Carte des sites où de l’ADN de mammifères plus ancien que 30 ka a été retrouvé

Dent de Paranthropus robustus SKX 11 provenant de Swartkrans (26°00'S 27°45'E), Gauteng, Afrique du Sud vers 1,8 million d'années. Collection du Transvaal Museum, Northern Flagship Institute, Pretoria – Différentes vues du même spécimen - Afrique du Sud. (21,53 × 15,20 ×15,49 mm)

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Dent de Paranthropus robustus SKX 11

L’hémagglutinine H5 normale fixant de l’acide sialique sur un glycane d’un récepteur d’origine aviaire (à gauche) et la forme mutée (à droite) fixant de l’acide sialique sur un récepteur d’origine mammalienne.

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Les hémagglutinines H5 normale et mutée fixant des récepteurs aviaires ou mammaliens

Les sialyltransférases ST3Gal1 (représentée en vert clair) et ST6Gal1 (représentée en vert foncé) sont attachés à la membrane de l’appareil de Golgi (représentée en gris) par l’intermédiaire d’un lien flexible, schématisé sur cette figure. La sialyltransférase ST3Gal1 est représentée liée à une molé...

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Les sialyltransférases ST3Gal1 et ST6Gal1
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