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La reconnaissance eRF-codon stop (non détaillée ici) repose sur l’établissement de liaisons faibles entre des chaînes latérales des acides α-aminés d’eRF et les trois bases du codon stop.

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Terminaison de la traduction par fixation de la protéine eRF sur un codon stop

En boules : les extrémités 3’ des deux ARNt (site A et site P) ; en bâtonnets : les deux bases azotées du site actif du ribozyme, dans l’ARNr 23S. NB : chez les Eucaryotes, c’est l’ARNr 28S qui porte cette activité enzymatique. Figure obtenue avec LibMol, à partir du fichier 4V5D.

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L’activité peptidyl-transférase catalysée par le ribosome bactérien

1. La petite sous-unité du ribosome, déjà chargée avec l’ARN initiateur, se fixe à l'ARN messager 2. Ce complexe parcourt l’ARN messager dans le sens 5’ → 3’ jusqu’à rencontrer le site d’initiation. 3. La grande sous unité se fixe. L’ARNt initiateur est au niveau du site P. 4. Un ARNt entre au nivea...

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Mécanisme de l’initiation de la traduction

Les parties protéiques des sous-unités sont représentées sous forme de boules, lilas pour la grande sous-unité, et jaune pour la petite sous-unité. Les ARN ribosomiques sont quant à eux représentés sous forme de rubans, vert pour la grande sous-unité, safran pour la petite. Un ARNt est représenté (e...

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Structure d’un ribosome cytosolique humain

Ces enzymes ont la particularité de posséder deux activités enzymatiques distinctes : une activité adénosyl-transférase (fixation d’un AMP sur l’acide α-aminé) et une activité aminoacyl-transférase (fixation de l’acide aminé sur les différents ARNt associés à cet acide aminé).

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Fonctionnement simplifié des aminoacyl-ARNt-synthétases

Gauche : structure tridimensionnelle de l’ARNt complémentaire du codon UUU, correspondant à la phénylalanine. Droite : représentation de la structure secondaire de ce même ARNt, la boucle de l’anticodon étant appariée au codon lui correspondant sur l’ARNm. Pour les explications concernant l’appariem...

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Structure d’un ARNt et complémentarité codon-anticodon

Les pyrimidines (U et C) sont représentées en rouge et les purines (A et G) en noir. Les quatre codons particuliers (codon Met initiateur, et les trois codons stop) sont colorés en jaune.

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Le code génétique représenté sous forme de tableau

L’extrait de séquence d’ARNm AGUUUCUCUAAUC peut être traduit en trois peptides totalement différents, selon le cadre de lecture, c’est-à-dire la façon de regrouper par trois les nucléotides.

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Importance du cadre de lecture dans la traduction de la séquence de nucléotides d'un ARN messager

Le codon initiateur et le codon stop sont indiqués : ils encadrent, dans l’ARN messager (ARNm), la séquence codante (représentée en vert foncé). Les extrémités 5’-UTR et 3’-UTR (représentées en vert clair) sont les régions non codantes situées respectivement avant le codon initiateur et après le cod...

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La traduction : passage d’un ARNm à une protéine
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