Cereblon en configuration ouverte ou fermée liée au mezigdomide et au facteur de transcription Ikaros
La protéine cereblon représentée seule, en configuration ouverte, à gauche, liée au mezigdomide (en orange) au centre, donc en position fermée, ou liée au mezigdomide et au facteur de transcription Ikaros (en rose). L’illustration a été créée à partir des entrées PDB (8cvp, 8d7u et 8d7z).
Le PROTAC MZ1 (représenté en jaune ainsi que sous la forme de bâtonnets) se lie en même temps à une protéine cible, BRD4, (en rose) et à la protéine von Hippel-Lindau du complexe ubiquitine-ligase E3 (en bleu). L’illustration a été créée à partir des entrées PDB 5t35 et 5n4w.
La protéine cereblon (représentée en bleu) est liée au pomalidomide, un analogue du thalidomide (représenté en orange et aussi sous la forme de bâtonnets) et au facteur de transcription Ikaros (en rose). L’illustration a été construite à partir des entrées PDB 6h0f et 4a0k.
À gauche : le complexe de désubiquitinylase PR-DUB (à gauche, en rose, 8h1t et 8svf) élimine l’ubiquitine (en rouge) au niveau de H2AK119. Le module DUB de SAGA (à droite, 4zux) élimine l’ubiquitine au niveau de H2BK120.
Le complexe répressif Polycomb 1 (PRC1, en haut à gauche, 4r8p) lie l’ubiquitine à la lysine 119 de l’histone H2A (en bas à gauche, 8g6q 1). Le module d’ubiquitinylation de PRC1 est constitué de Ring1B et Bmi1 (représentés chacun dans une nuance de jaune), qui agissent ensemble en tant que ligase E3...
En haut : enzymes responsables de l’ubiquitinylation :
à gauche : le complexe répressif Polycomb 1 PRC1, qui lie l’ubiquitine à la lysine 119 de l’histone H2A ;
à droite : le complexe Bre1-Rad6, qui lie une ubiquitine à la lysine 120 de l’histone H2B.
En bas : enzymes responsables de la désubiquiti...
