À gauche : le complexe de désubiquitinylase PR-DUB (à gauche, en rose, 8h1t et 8svf) élimine l’ubiquitine (en rouge) au niveau de H2AK119. Le module DUB de SAGA (à droite, 4zux) élimine l’ubiquitine au niveau de H2BK120.
Le complexe répressif Polycomb 1 (PRC1, en haut à gauche, 4r8p) lie l’ubiquitine à la lysine 119 de l’histone H2A (en bas à gauche, 8g6q 1). Le module d’ubiquitinylation de PRC1 est constitué de Ring1B et Bmi1 (représentés chacun dans une nuance de jaune), qui agissent ensemble en tant que ligase E3...
La protéine cereblon représentée seule, en configuration ouverte, à gauche, liée au mezigdomide (en orange) au centre, donc en position fermée, ou liée au mezigdomide et au facteur de transcription Ikaros (en rose). L’illustration a été créée à partir des entrées PDB (8cvp, 8d7u et 8d7z).
Les histones eucaryotes (représentées en vert à gauche, entrée PDB 1aoi) forment des octamères à partir de paires de dimères d’histones. Les dimères H2A-H2B et H3-H4 sont représentés en haut, avec leurs queues complètes. À droite, HMfB (représentée en orange, entrée PDB 5t5k) est une histone d’arché...
Le PROTAC MZ1 (représenté en jaune ainsi que sous la forme de bâtonnets) se lie en même temps à une protéine cible, BRD4, (en rose) et à la protéine von Hippel-Lindau du complexe ubiquitine-ligase E3 (en bleu). L’illustration a été créée à partir des entrées PDB 5t35 et 5n4w.
La protéine cereblon (représentée en bleu) est liée au pomalidomide, un analogue du thalidomide (représenté en orange et aussi sous la forme de bâtonnets) et au facteur de transcription Ikaros (en rose). L’illustration a été construite à partir des entrées PDB 6h0f et 4a0k.
