L’arbre montre les principaux groupes d’Eucaryotes (en termes de nombre d’espèces, d’importance écologique ou sanitaire). Les relations de parenté sont données d’après Keeling et Burki, 2019 1. Des exemples ainsi que des illustrations de membres des différents taxons sont donnés à droite.
Les évènements d’endosymbiose sont indiqués sur l’arbre sous forme de ronds contenant un I pour les endosymbioses primaires et un II pour les endosymbioses secondaires. La couleur du rond traduit le type d’organisme endocyté : cyan pour une cyanobactérie, vert pour un membre des Chloroplastidés (« algues vertes »), rouge pour un membre des Rhodophytes (« algues rouges »). Chez les Cercozoaires, les plastes des Chlorarachniophytes sont issus d’une endosymbiose secondaire avec un Chloroplastidé tandis que ceux de Paulinella chromatophora sont issus d’une endosymbiose primaire avec une cyanobactérie.
Les miniatures sont issues de Keeling et Eglit, 2023 2.