Le biais de la paralogie dans la reconstruction phylogénétique
A. Histoire phylogénétique réelle d’une lignée montrant les évènements de spéciation et de diversification génétique avec l’exemple des allèles A et B issus d’un même allèle ancestral. Les allèles A et B sont deux versions d’un même gène qui coexistent chez les trois espèces.
B. Arbre phylogénétique des espèces biaisé, construit avec les séquences des allèles A des espèces 1 et 3, et la séquence de l’allèle B de l’espèce 2. Les allèles A et B sont paralogues.
C. Arbre phylogénétique des espèces non biaisé, construit avec les séquences des allèles A des trois espèces. Les différentes versions de l’allèle A sont orthologues.
Des synapomorphies de certains clades sont indiquées par des ronds bleus.
D'après The Pteridophyte Phylogeny Group, 2016 1 et Lecointre et Le Guyader, 2016 2.
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I, P. . (2016). A community‐derived classification for extant lycophytes and ferns. Journal of Systematics and ...
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