Les bactéries sont incluses, sous forme de bactéroïdes, dans la membrane péribactéroïde, d’origine végétale. L’ensemble se comporte comme un organite, le symbiosome, spécialisé dans la fixation du diazote venant de l’atmosphère. Selon les espèces hôtes, chaque symbiosome peut contenir une seule ou plusieurs bactéries, soit par fusion de plusieurs symbiosomes, soit par division bactérienne.