La protéine dArc1 (entrée PDB 6TAP), un homologue de la protéine Arc des mammifères présent chez les drosophiles, forme des capsides icosaédriques composées d'hexamères (représentés en jaune) et de pentamères (représentés en orange).
La comparaison des structures de dArc1 (capside représentée à partir de l’entrée PDB 6TAP ; pentamère représenté à partir de l’entrée PDB 6TAR), du rétrovirus VIH (capside représentée à partir de l’entrée PDB 3J3Q ; pentamère représenté à partir de l’entrée PDB 7URN) et du rétrotransposon Ty3 (entré...
Les différents nucléotides sont représentés sous leur forme ionisée. Ils mesurent environ 1,1 nm. Le plus petit des acides aminés, la glycine, a une longueur d’à peu près 0,4 nm tandis que le plus grand, le tryptophane, mesure environ 1 nm.
Source des images : Jynto, CC0, Wikimedia : adénosine monop...
La protéine porteuse d’acyle (ACP) représentée à droite était absente de la structure déterminée expérimentalement et est représentée attachée au domaine de la cétoréductase par l’intermédiaire d’un lien flexible. D'après l'entrée PDB 7S6B de la banque de données sur les protéines (PDB).
Les sialyltransférases ST3Gal1 (représentée en vert clair) et ST6Gal1 (représentée en vert foncé) sont attachés à la membrane de l’appareil de Golgi (représentée en gris) par l’intermédiaire d’un lien flexible, schématisé sur cette figure. La sialyltransférase ST3Gal1 est représentée liée à une molé...
Le lénacapavir (représenté en cyan) se lie dans une poche entre les monomères de protéines CA d’un hexamère de capside du VIH (représentés en jaune, entrée PDB 6v2f).
