La protéine dArc1 (entrée PDB 6TAP), un homologue de la protéine Arc des mammifères présent chez les drosophiles, forme des capsides icosaédriques composées d'hexamères (représentés en jaune) et de pentamères (représentés en orange).
La comparaison des structures de dArc1 (capside représentée à partir de l’entrée PDB 6TAP ; pentamère représenté à partir de l’entrée PDB 6TAR), du rétrovirus VIH (capside représentée à partir de l’entrée PDB 3J3Q ; pentamère représenté à partir de l’entrée PDB 7URN) et du rétrotransposon Ty3 (entré...
Le lénacapavir (représenté en cyan) se lie dans une poche entre les monomères de protéines CA d’un hexamère de capside du VIH (représentés en jaune, entrée PDB 6v2f).
Le codon initiateur et le codon stop sont indiqués : ils encadrent, dans l’ARN messager (ARNm), la séquence codante (représentée en vert foncé). Les extrémités 5’-UTR et 3’-UTR (représentées en vert clair) sont les régions non codantes situées respectivement avant le codon initiateur et après le cod...
Un atome de zinc central stabilise le repliement de la protéine en établissant quatre liaisons avec deux résidus cystéine (en haut) et deux résidus histidine (en bas). On trouve également des structures en doigt de zinc faisant intervenir quatre résidus cystéine.
