La protéine EF possède une activité adénylate cyclase, elle provoque une hausse de l’AMPc intracellulaire, d’où une activation incontrôlée des kinases dépendantes de l'AMPc (cette activité est dépendante du calcium, via la calmoduline).
La protéine PA permet l’internalisation du facteur (EF ou LF) avec lequel elle est associée.
La protéine LF est une métalloprotéase à zinc qui conduit à la surexpression de cytokines par les macrophages.