L’ADN des spermatozoïdes est organisé de trois façons. La majorité de l’ADN est enroulé dans des structures toriques dont l’empilement permet de minimiser l’encombrement. Cette structure en tore est stabilisée par des protamines qui neutralisent la répulsion qui se produirait sinon entre les groupements phosphates chargés négativement du squelette de l’ADN. Une petite fraction de l’ADN est associé à des histones dans des solénoïdes. Le reste de l’ADN est associé à la matrice nucléaire au niveau de zones appelées régions d’attachement à la matrice.