Les protéines motrices associées aux microtubules, la dynéine (en violet) et la kinésine (en rouge), forment le complexe moteur/adapteur avec les protéines Milton/TRAK1/2 (en jaune) et Miro (en orange), ces dernières étant insérées dans la membrane externe mitochondriale. La dynéine assure le transport vers le pôle − des microtubules, la kinésine vers le pôle +.
Les mitochondries peuvent également se déplacer le long des microfilaments d'actine grâce à différentes formes de myosine.