L’invalidation d’un gène est le remplacement de ce gène, dans le génome de l’organisme, par une version modifiée, inactive, de ce gène.
Dans cet exemple, le gène A est remplacé par un autre gène : lacZ. Ce remplacement est permis par la présence de séquences identiques entre la construction et le génome de l’organisme, au niveau desquelles peut se réaliser une recombinaison homologue.