A. Un vecteur a été réalisé : plasmide portant le gène lacZ (dans notre exemple), entouré des séquences bordant le gène A dans le génome. Ce vecteur est introduit dans des cellules ES.
B. Dans quelques cellules ES, un évènement de recombinaison homologue a lieu : grâce à une reconnaissance des séquences communes entre le vecteur et le génome de la cellule, une copie du gène A est remplacée par la construction portée par le vecteur (ici, le gène lacZ).
C. La majorité des cellules ES n’a en fait pas réalisé cette recombinaison homologue. Les quelques cellules ES qui l’ont réalisée sont sélectionnées, multipliées, et vont permettre la suite du protocole.