Les animaux dont la taille excède 2 mm sont considérés dans la macrofaune (les cloportes, les mille-pattes, les mollusques, les vers de terre et beaucoup d’arachnides et d’insectes, mais aussi les mammifères), ceux dont la taille est comprise entre 200 μm et 2 mm appartiennent à la mésofaune (collemboles, acariens ou encore enchytrées), et les organismes dont la taille est inférieure à 200 µm sont regroupés dans la microfaune (protozoaires et nématodes). Ces limites sont arbitraires et la gamme de taille de certains taxons chevauche plusieurs groupes.