La TBP est la première protéine qui reconnaît une séquence spécifique de l'ADN initiatrice de la transcription (la boite TATA). Le facteur TFIIB semble impliqué dans la sélection précise du site d'initiation (nucléotide à partir duquel se déroule la transcription). Le facteur TFIIH comporte plusieurs activités enzymatiques dont une activité hélicase permettant l'ouverture de la double hélice d'ADN au niveau du promoteur, et une activité kinase responsable de la phosphorylation de la queue C-terminale de l'ARN polymérase II. Cette phosphorylation provoque une modification de la structure tridimensionnelle de l'ARN polymérase qui entraîne la dissociation du complexe d'initiation et le début de la transcription.
TFII = Transcription Factor for RNApolymerase II (facteurs généraux de la transcription pour l'ARN polymérase II).
TBP = TATA box-Binding Protein (protéine de liaison à la boite TATA).