Comparaison entre la structure de la protéine ORF8 du SARS-CoV-2 prédite par AlphaFold2 et celle déterminée expérimentalement
La structure d’ORF8 du SARS-CoV-2 prédite par l’équipe d’AlphaFold2 et soumise au concours CASP 14 est représentée en jaune. La structure obtenue expérimentalement (entrée PDB 7jtl), qui a été révélée par cristallographie aux rayons X sous forme de dimère, est représentée en orange.
La comparaison des structures prédites au cours de différents concours CASP (en haut, en jaune) avec les structures déterminées expérimentalement (en bas, en orange). À gauche, la protéine RUMGNA_01417 de la bactérie pathogène Ruminococcus gnavus, au centre la protéase pUL26N du virus de la pseudo-r...
Le bactériophage synthétique Evo-Φ36 est représenté en haut et en bas à gauche (entrée PDB 36cr), tandis que le bactériophage ayant servi de référence, ΦX174 (entrée PDB 36cq), est représenté en bas à droite. Les structures du bas montrent la capside virale en coupe. La protéine J est représentée&nb...