Protéase sauvage du VIH-1 associé à l’inhibiteur (en haut, à gauche) et protéase mutée du VIH-1 associée de manière plus lâche au saquinavir (en haut, à droite). Les images correspondantes, en bas, font apparaître (de manière approximative) la poche du site actif.
Le saquinovir est un inhibiteur de la protéase du VIH-1. Il agit en se fixant au niveau du site actif de cette enzyme. Des études structurales ont permis de démontrer que la mutation de la glycine 48 de cette protéase (G48 sur la figure de gauche) en une valine (V48 sur la figure de droite) a d’importantes conséquences au niveau de la fixation de l’inhibiteur : le saquinovir (en bleu sur la figure) se fixe toujours au niveau du site actif, mais de manière bien plus lâche. La comparaison des deux figures permet de distinguer clairement que l’inhibiteur est plus éloigné de la protéine chez le mutant (figure de droite) que chez le sauvage (figure de gauche). Il apparaît ainsi que la mutation G48V (glycine mutée en valine) se traduit par une résistance de la protéase à l’action du saquinovir.