La reconnaissance eRF-codon stop (non détaillée ici) repose sur l’établissement de liaisons faibles entre des chaînes latérales des acides α-aminés d’eRF et les trois bases du codon stop.
L'ARN ribosomique est en bleu clair et les protéines en bleu plus foncé. Les illustrations montrent la partie de la sous-unité qui interagit avec la grande sous-unité ribosomale.
En boules : les extrémités 3’ des deux ARNt (site A et site P) ; en bâtonnets : les deux bases azotées du site actif du ribozyme, dans l’ARNr 23S. NB : chez les Eucaryotes, c’est l’ARNr 28S qui porte cette activité enzymatique. Figure obtenue avec LibMol, à partir du fichier 4V5D.
Le codon initiateur et le codon stop sont indiqués : ils encadrent, dans l’ARN messager (ARNm), la séquence codante (représentée en vert foncé). Les extrémités 5’-UTR et 3’-UTR (représentées en vert clair) sont les régions non codantes situées respectivement avant le codon initiateur et après le cod...