L’activité peptidyl-transférase catalysée par le ribosome bactérien
En boules : les extrémités 3’ des deux ARNt (site A et site P) ; en bâtonnets : les deux bases azotées du site actif du ribozyme, dans l’ARNr 23S. NB : chez les Eucaryotes, c’est l’ARNr 28S qui porte cette activité enzymatique. Figure obtenue avec LibMol, à partir du fichier 4V5D.
1. La petite sous-unité du ribosome, déjà chargée avec l’ARN initiateur, se fixe à l'ARN messager
2. Ce complexe parcourt l’ARN messager dans le sens 5’ → 3’ jusqu’à rencontrer le site d’initiation.
3. La grande sous unité se fixe. L’ARNt initiateur est au niveau du site P.
4. Un ARNt entre au nivea...
L'ARN ribosomique est en bleu clair et les protéines en bleu plus foncé. Les illustrations montrent la partie de la sous-unité qui interagit avec la grande sous-unité ribosomale.
La reconnaissance eRF-codon stop (non détaillée ici) repose sur l’établissement de liaisons faibles entre des chaînes latérales des acides α-aminés d’eRF et les trois bases du codon stop.
