Emmanuel Montassier est professeur de thérapeutique à l’université de Nantes et médecin urgentiste au CHU de Nantes. Il est le président de la Commission du médicament et des dispositifs médicaux stériles du CHU de Nantes. Il est membre de la commission scientifique de la Société française de médecine d'urgence, et membre du comité éditorial des Annales françaises de médecine d'urgence. Il a effectué un post-doctorat à l'université du Minnesota dans le laboratoire du Professeur Daniel Knights, expert dans l'analyse bio-informatique des données du microbiote. Emmanuel Montassier est membre du CR2TI-U1064 (The Center for Research in Transplantation and Translational Immunology). Ses thématiques de recherche sont l'étude de biomarqueurs du microbiote et la modulation du microbiote pour prédire les complications des patients graves.